L'Institut du droit équin est administré par un Comité Directeur élu par l'Assemblée Générale des membres. Il se réunit plusieurs fois par an pour décider des projets à mettre en oeuvre par l'association. Il est composé des 3 collèges suivants :
Guy HOURCABIE, éleveur de chevaux,
Philipe LASSALAS, vétérinaire et expert de justice,
Axelle MAITRE, secrétaire générale de l'hippodrome de Clairefontaine,
Michel MARTIN-SISTERON, vétérinaire et expert de justice.
Christian BEUCHER, avocat,
Manuel CARIUS, magistrat,
Hervé DESSE CARMIGNAC, avocat,
Florence de FREMINVILLE, avocat,
Blanche de GRANVILLIERS, avocat,
Lauren SIGLER, avocat.
Richard CORDE, représentant l'Association Vétérinaire Equine Française (AVEF),
Richard CREPON, représentant l'Association des Entraîneurs au Galop,
Luc KRONUS, représentant la Fédération des Eleveurs du Galop,
Ludovic de VILLELE, représentant la Fédération Française d'Equitation (FFE).
Aux membres de ces 3 collèges, s'ajoutent les représentants des membres fondateurs de l'Institut du droit équin :
Charles DUDOGNON, représentant le Centre de Droit et d'Economie du Sport,
Gérard MAJOURAU, représentant l'Institut Français du Cheval et de l'Equitation.
Président : Guy HOURCABIE,
Vice-président : Charles DUDOGNON,
Secrétaire général : Christian BEUCHER,
Secrétaire adjoint : Hervé DESSE CARMIGNAC,
Trésorier : Gérard MAJOURAU.